Isabelle Duthoit termine ses études de clarinette au CNSM de Lyon dans la classe de Jacques Di Donato en 1995 puis obtient son Certificat d’Aptitude pour l’enseignement en 1997. Elle s’oriente très vite vers les musiques d’aujourd’hui en travaillant avec de nombreux compositeurs. Elle trouve ensuite son univers de prédilection dans l’improvisation libre. Elle collabore avec de nombreux artistes de la scène expérimentale internationale. Dieb13, Angelica Castello, Martin Tetreault, Franz Hautzinger, Hamid Drake, Michael Zerang, Phil Minton, Andy Moor, Thomas Lehn, Jacques Di Donato, Steve Heather, Sophie Agnel. Elle est membre de plusieurs groupes comme Hiatus, Système Friche, Where is the sun, Uruk, Iki, NYX,Sun Dog. Elle joue dans de nombreux festivals en Australie, Nouvelle Zélande, Canada, Etats Unis, Zimbabwe, Afrique du Sud, Russie, Europe , Japon.
Depuis toujours intéressée par la voix, elle développe depuis 20 ans une technique singulière et personnelle. Un langage avant le langage, une voix de l’origine. Un chant qui prend ses racines autant dans le souffle que le cri… Écouter Isabelle Duthoit, c’est faire l’expérience d’une voix qui ne dit rien mais qui actualise des sensations premières liées au son, à l’intimité du son et que l’on perçoit bien plus par notre peau que par nos oreilles…. écrit Lê Quan Ninh. Elle travaille régulièrement avec la danse, Cie Li(luo) et le théâtre (la Revue Eclair, la Cie Roland Furieux, Henri Jules Julien). En janvier 2020, avec Libelle elle introduit dans sa création son travail graphique (dessins, photos, autoportraits). Avec Portraits chantés, en compagnie du dessinateur Troubs, elle cherche le rapport entre voix et dessin. Isabelle Duthoit a été résidente à la Villa Kujoyama à Kyoto au Japon en 2008 pour étudier le cri dans le chant Nô, la récitation du Bunraku et l’iaido. Avec Jacques Di Donato elle a co-dirigé le festival Fruits de Mhère durant 10 ans, elle a enseigné la clarinette au CRD D’Evry.  De 2014 à 2019 elle a animé des ateliers de voix au théâtre des Quinconces l’Espal scène Nationale du Mans. Avec Franz Hautzinger, elle a organisé le  festival Paysages d’écoute dans ce même théâtre.